三格化糞池由相聯的三個水池組成，況且半中腰由過糞管聯通主要是利用厭氧氣發酵、況且中層過糞和寄生蟲卵比重大于普通混合液比重而便于沉淀的原理。
屎尿在池內通過30天以上的發酵分解，并且中層糞液順次由1池流至3池，因此達到沉淀或殺滅屎尿中寄生蟲卵和腸道致病菌的目標，況且第3池糞液變成優質化肥。
三格化糞池廁所的地下局部結構由便器和進糞管、過糞管和糞池以及蓋板五局部組成。冷卻塔由工廠加工出產或白行預制，便器認為合適而使用直通式與進糞管連接，也可運用水封式便器不再安裝近糞管。
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